TREZZA ALFONSO

Alfonso
Trezza
Ricercatore Legge 240/10 - tempo determinato

Presentazione

Allineamenti di sequenza proteiche, geniche e genomiche (Dot Plot, Dynamic Programming, Heuristic, Iterative, Hidden Markov models, ect.). Modeling di strutture tridimensionali proteiche (strutture terziarie e quaternarie) con approcci di Homology Modeling, predizione di strutture 3D de-novo e threading proteico.

Identificazione di siti di legame sulla superfice 3D proteica con approcci strutturali, dinamici ed evoluzionistici. Identificazione di siti di legame peculiari sulla superfice 3D di target biologici, finalizzati all’individuazione per potenziali terapie nel campo della medicina di precisione.

Docking computazionale (structure and ligand based Virtual Screening) per l’interazione fra proteina-proteina/peptide/ligando/D.N.A./R.N.A. (force field, empirical and knowledge based algorithms). Analisi evoluzionistiche (Entropia, Structural-Activity Relationship, MSA, ect.) ed energetiche (Poisson–Boltzmann, generalized Born and surface area continuum solvation, LJ-SR, Coul-SR, ect.) del network di interazione (statico e dinamico) fra sistemi biologici.

Simulazioni di dinamiche molecolari classiche, meta-dinamiche e dinamiche molecolari accelerate di sistemi biologici semplici e complessi (proteine solubili, proteine di membrana, metallo-enzimi, D.N.A., R.N.A.,) e interazione fra essi. Analisi strutturali ed energetiche dei profili dinamici dei sistemi biologici.

Studi sulla: i) stabilità e sui processi di folding/unfolding proteici (processi Arrhenius e non-Arrhenius dipendenti) ii) farmaco-resistenza iii) mutagenesi iv) interattoma v) evoluzione proteica vi) strategie multi-target.

I principali target biologici studiati nell’insorgenza di patologie coinvolgono: i) cancro ii) malattie cardiovascolari iii) infezioni virali (EBOLA, SARS-CoV-2) iv) recettori coinvolti nella fototrasduzione visiva v) malattie neurodegenerative (Alzheimer, sindrome di Dejerine–Sottas) vi) malattie genetiche rare ed ultra rare (AKU, Sindrome di Stargardt).

Orari di ricevimento

Lunedì-Venerdì dalle ore 9:00 alle ore 19:00

Luogo: Stanza 30-221 (3° piano/Lotto II - Plesso laboratori scientifici)

N.B: Gli orari di ricevimento possono variare in base agli impegni accademici.

E' fortemente consigliato di contattare preventivamente il docente via e-mail per fissare un appuntamento.

Curriculum Vitae

Attività didattica

ANNO ACCADEMICO DI ESPLETAMENTO: 2023/2024

Anno di corso: 1 Corso di Laurea Magistrale CHEMISTRY A.A. 2023/2024

Attività di ricerca

Ultime pubblicazioni:

  • Ahmed, A., Trezza, A., Gentile, M., Paccagnini, E., Panti, A., Lupetti, P., et al. (2023). Dynamin-independent CaV1.2 and KCa1.1 channels regulation and vascular tone modulation by the mitochondrial fission inhibitors dynasore and dyngo-4a. EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACOLOGY, 951, 1-14 [10.1016/j.ejphar.2023.175786]. - dettaglio
  • Niccolai, N., Trezza, A., Marchini, F., Bongini, P., Bianchini, M., Santucci, A., et al. (2023). Omicron variants of SARS CoV-2 indicate a new antiviral strategy: Interfere with spike glycoprotein trimerization. APPLIED CHEMICAL ENGINEERING, 6(3) [10.24294/ace.v6i3.2325]. - dettaglio
  • Bisi, A., Feoli, A., Trezza, A., Viejo, L., Formaggio, F., Bartolini, M., et al. (2022). Targeting neuronal calcium channels and GSK3β for Alzheimer's disease with naturally-inspired Diels-Alder adducts. BIOORGANIC CHEMISTRY, 129, 106152 [10.1016/j.bioorg.2022.106152]. - dettaglio
  • Carullo, G., Falbo, F., Ahmed, A., Trezza, A., Gianibbi, B., Nicolotti, O., et al. (2022). Artificial intelligence-driven identification of morin analogues acting as CaV1.2 channel blockers: Synthesis and biological evaluation. BIOORGANIC CHEMISTRY, 131, 1-11 [10.1016/j.bioorg.2022.106326]. - dettaglio
  • Trezza, A., Mugnaini, C., Corelli, F., Santucci, A., Spiga, O. (2022). In Silico Multi-Target Approach Revealed Potential Lead Compounds as Scaffold for the Synthesis of Chemical Analogues Targeting SARS-CoV-2. BIOLOGY, 11(3), 465 [10.3390/biology11030465]. - dettaglio